學校創辦于1934年，時名湖南國醫專科學校，1960年改辦為普通高等本科院校湖南中醫學院，2002年湖南省中醫藥研究院與湖南中醫學院合併，2006年經教育部批准更名為湖南中醫藥大學。目前學校與湖南省中醫藥研究院實行校院合一的管理體制。學校現有含浦、東塘2個校區，總占地面積1271畝，校舍建築面積36萬平方米。現有3所直屬附屬醫院，9所非直屬附屬醫院，2個校辦合資企業。學校下設16個學院（部）、14個研究所。學校現有學生總人數26577人，其中研究生1477人、全日制本科生16413人、專科生656人、成人學歷教育學生7854人、留學生177人。
目前，學校開設21個本科專業，分屬於醫學、理學、工學、管理學、文學5個學科門類。現有4個國家級特色專業建設點，7個省級特色專業建設點。中醫學專業開設7年制本碩連讀專業，設置有中醫學臨床、中西醫臨床和針灸推拿學3個專業方向。
學校構建了以醫學學科為主體，醫、理、工、管、文等學科門類協調發展的學科體系。擁有中醫學、中西醫結合2個博士後科研流動站。學校的優勢科研項目有病證診療標準化與客觀化研究，中藥超微技術與創新藥物研究，針灸---經絡原理研究，婦科血症研究，中藥材育種、栽培、管理、標準化研究，心腦血管病、肝病、腫瘤、糖尿病、眼底病、免疫性疾病等疑難重大疾病的防治研究，並打造了相應的科技創新團隊。
學校有直屬附屬醫院3所，非直屬附屬醫院9所，共有病床9532張。第一附屬醫院被列為國家中醫臨床研究基地建設單位，第二附屬醫院被列為全國重點建設中醫院，附屬中西醫結合醫院為十所全國重點建設中西醫結合醫院之一。附屬醫院醫療設施先進，臨床科室設置齊全，擁有一批知名的中醫臨床專家。擁有肝病、眼底病、皮膚瘡瘍病、肛腸病、兒科、骨傷科、不孕不育科、心血管內科、腦病、腫瘤等11個國家重點中醫專科（專病）中心。
有國家藥品臨床研究基地3個。學校積極開展國際交流與合作，拓展外部發展空間。我校為全國高等中醫藥院校中首批招收港澳臺及外國留學生的單位，2009年獲批為國家中醫藥管理局中醫藥國際合作基地。現有在籍留學生和港澳臺學生289人。湖南國際針灸培訓中心設於我校，已為28個國家和地區培訓了700多名學員。1990年以來，學校先後多次選派專家、教授赴英國等20多個國家和地區留學訪問，並派出數批醫療隊赴俄羅斯等多個國家防病治病。與美、英、日等國家的高等學校和科研機構開展合作；與加拿大中央學院、香港大學、澳門科技大學、新加坡中醫學院等建立了醫療、教學、科研合作關係。近年來，學校辦學條件不斷改善，辦學規模穩步擴大，教學品質穩步提高，科研水準大幅上升，醫療服務水準不斷提高，產業發展勢頭良好，已發展成為一所以本科教育為主、具有完整高等教育辦學層次和多個學科門類、多種辦學形式、辦學綜合實力較強的高等中醫藥院校。
